PhD Maël Ansart - Caractérisation structurale et fonctionnelle de l'Exosome à ARN chez les archées Thermococcales

Maël Ansart, Biologie des ARN chez les Archées, MCD-CBI Le rôle physiologique et les voies de dégradation des ARN médiée par l’Exosome reste encore à éclaircir chez les archées, et notamment chez les archées hyperthermophiles où le complexe doit prendre en charge des ARN protégés contre les hautes températures. Dans l’objectif de mieux caractériser les processus cellulaires qui impliquent l’Exosome, et le rôle de ses protéines de coiffes, nous avons étudié la structure, l’activité et le réseau d’interaction de l’Exosome des Thermococcales. Rrp4 semble avoir un rôle de recrutement de substrats ARN, alors que Csl4 joue le rôle d’une plateforme d’interaction pour de nombreux partenaires. Le réseau d’interaction protéique de l’Exosome suggère qu’il coopère avec d’autres protéines du métabolisme des ARN, tel que l’hélicase ASH-Ski2, les ribonucléases aRNase J et HII ainsi que des acétylases et méthylases d’ARN. L’interactome de Csl4 suggère une association entre le ribosome et l’Exosome archéen, qui pourrait provenir d’un système de contrôle qualité des ARNm encore inconnu. Nous avons également découvert de nombreuses protéines impliquées dans la réparation des cassures double brin de l’ADN dans l’interactome de l’Exosome, suggérant qu’il pourrait jouer un rôle dans la maintenance du génome. Enfin, nous avons découvert un nouveau partenaire direct de l’Exosome, aIF2Bα qui interagit par l’intermédiaire de Csl4-DnaG. Le rôle physiologique de ce facteur est encore inconnu, mais sa proximité avec de nombreuses protéines du métabolisme suggère qu’il pourrait lier l’activité de l’Exosome à la situation énergétique cellulaire. Bien que de nombreuses questions demeurent, en particulier l’implication de l’Exosome dans la réparation de l’ADN, la stœchiométrie de la coiffe et le choix des substrats, ces travaux apportent de nouveaux éléments sur le rôle cellulaire de ce complexe de dégradation des ARN.